2012四月:Nature评论性亮点文章汇总

2012四月:Nature评论性亮点文章汇总

1.EPEC将肌动蛋白放在Map上

Cellular microbiology:EPEC puts actin on the Map

最近的一篇《细胞》论文提供了导致肠病的大肠杆菌(EPEC)效应物线粒体相关蛋白(Map)和宿主蛋白细胞分裂周期42(CDC42)之间相互作用的深刻理解,在这一过程中,揭示了肌动蛋白作为真核细胞信号转导的空间和时间调节器所扮演的新角色。

能够调节细胞骨架的RHO家族GTP酶是许多真核细胞信号路径的重要成分,正因为如此,它们也是致病菌的主要目标。EPEC3型分泌效应物Map是一种鸟嘌呤核苷酸交换因子(GEF),已知能够激活RHO家族GTP酶CDC42。随着将其注入宿主细胞,Map接触到宿主蛋白质EBP50(也被称为NHERF1),并且Map–EBP50复合体在细胞膜上激活了CDC42,导致了丝状伪足的局部形成。

2.脱去oncometabolite的面具

Metabolism:Unmasking an oncometabolite

异柠檬酸脱氢酶1(IDH1)与IDH2在一个神经胶质瘤和白血病子集中发生了突变。这些酶的突变赋予它们以新的功能:2-羟戊二酸(2HG)的产生代替α-酮戊二酸(α-KG)。新的数据表明,2HG通过对DNA、组蛋白甲基化、缺氧诱导因子1α(HIF1α)和HIF2α的作用改变了基因的转录。

具有IDH突变的神经胶质瘤具有一个CpG岛状甲基化表型(CIMP),为了确定这些情况是否联系在一起,Timothy Chan和同事在表达野生型IDH1或突变IDH1的同基因星形胶质细胞中比较了DNA的甲基化模式。突变IDH1的表达导致了DNA甲基化的变化:主要甲基化加上一些低甲基化的区域。表达突变IDH1的星形胶质细胞中的甲基化的变化反映了CIMP-阳性神经胶质瘤中的甲基化模式。在较低级别神经胶质瘤(LGGs)中的基因集富集分析在表达突变IDH1的星形胶质细胞和具有CIMP的神经胶质瘤之间受影响的基因中识别出一种重要的调和关系。此外,由在表达突变IDH1的细胞中被下调的17个基因构成的一个基因表达信号能够将一个LGGs的独立集分类为CIMP阳性或阴性,表明IDH突变与CIMP关系非常紧密。染色质免疫沉淀反应试验表明,在表达突变IDH1的细胞中甲基化的基因与H3K9和H3K27组蛋白甲基化中的改变有关,表明组蛋白标记中的改变可能有助于DNA甲基化。这些作者还发现,表达突变IDH1的星形胶质细胞发育出一个与DNA甲基化相呼应的像干细胞一样的表型,表明突变IDH1可能防止了分化。

3.RXR拮抗剂逆转阿尔茨海默氏症

Neurodegenerative disease: RXR agonist reverses Alzheimer’s disease

淀粉体-β(Aβ)在大脑中的积聚被视为导致阿尔茨海默氏症(AD)的一系列事件的开始。然而,目标在于减少Aβ产生或聚集的治疗方法到目前为止都不成功。如今,据《科学》杂志报道,Cramer和同事证明,一种维甲酸X受体(RXR)拮抗剂能够迅速刺激Aβ清除,改善AD小鼠模型中的认知和行为缺陷。

从大脑中清除Aβ通常被胆固醇转运蛋白脂蛋白E(APOE)所促进,通过高密度脂蛋白(HDL)微粒的形成从而促进可溶Aβ的蛋白水解退化。APOE的表达被配体激活的核受体过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(PPARγ)与肝脏X受体(LXRs)——与RXRs形成异二聚体——所转录调控。之前,PPARγ或LXR拮抗剂的长期服用被表明能够减少Aβ水平,以及改进AD小鼠模型中的认知功能。考虑到这一点,Cramer和同事假设一种RXR拮抗剂能够发挥类似的有益功效。

4.X标记的胞吐点(预示囊泡融合模式)

Synaptic transmission:X marks the exocytotic spot (and foretells vesicle fusion mode)

越来越多的证据表明,海马中的快速刺激性突触在突触传导期间使用了胞外分泌的两种模式:全衰竭的融合(FCF),以及一种不完全的囊泡融合形式,被称为“吻与跑”(K&R)。Park等人如今指出,一个囊泡在融合之前在激活区度过的时间,以及融合影响的位点无论囊泡是否经历了FCF或K&R。

囊泡动力学以及K&R胞外分泌的存在一直颇受争议,这部分是由于很难实时以及高分辨率地确定突触囊泡的运动和行为。Park等人利用一项技术使得以纳米精确度在三维空间实时监测囊泡运动成为可能。他们在囊泡上加载了一个荧光标记物(量子点),并观察到场刺激导致约70%的胞吐标记囊泡在突触小结中运动;这种运动可能是正常的囊泡循环的一部分。作者进一步强调,囊泡在胞外分泌之前的激活区几乎是静止的,或许反映了对接过程。

随着一个囊泡采取细胞外猝灭剂,FCF能够被观察到一个突发的并且彻底的荧光性损失。位于融合位点附近——也就是说“易释放池”(RRP)的囊泡——的囊泡与位置更远的囊泡相比,经历了更快的胞外分泌。在一个网格蛋白调节的恢复过程之后,囊泡依然倾向于找到自己的方式回归接近融合位点激活区附近的区域。这意味着RRP囊泡具有在一个小结中辨识自身与其他突触泡池的分子特征。

5.占用与序列的复杂性

Functional genomics:Complexities of occupancy and sequence

基因组非编码区域的变化越来越多地被涉及到复杂性状间的个体差异,包括疾病易感性,然而阐释非编码变化的功能效应却是一项特殊的挑战。最近发表的两篇论文系统地研究了SNP对于转录因子结合的影响,从而表明尽管序列与结合之间的一些趋势正如预期的那样,但预测特定SNP的效应将是很困难的。

通过对源自跨越3代人的一个家族的12位成员的淋巴母细胞系进行测序(ChIP–seq),以及进行染色质免疫沉淀反应,Maurano等人对转录调节因子CTCF的结合位点进行了绘制。他们随后对间隔环绕每一个结合位点134bp的区域进行了定向测序,从而使他们拥有了总数超过35,000个CTCF结合位点的高分辨率的基因型和ChIP数据。在这些位点中,有21%至少与一个SNP重叠,使得他们能够探索SNP与位点占用之间的关系。总的来说,5.6%的多态性结合位点具有一个与CTCF占用有关的SNP基因型显著相关性,并且像预期的那样,影响占用的SNP中有85%位于44bp区域的范围之内,在这里CTCF能够在其结合位点与DNA进行接触。

6.流感的尾刺

Immune evasion:Influenza’s sting in the tail

一篇最近的《自然》论文揭示了H3N2甲型流感病毒非结构蛋白1(NS1)通过模拟一种组蛋白H3来抑制宿主的抗病毒反应。

在真核细胞中,组蛋白的氨基末端结构域——被称为组蛋白尾部——经历了广泛的转译后修饰,并且是基因功能的一个关键调节器,负责染色质复合物的组装。许多其他的蛋白质,包括细菌和病毒蛋白质,已知含有类似于部分组蛋白尾部的短基序,但是是否这些蛋白质的任何功能能够模拟组蛋白则尚未搞清。

Ivan Marazzi等人利用生物信息学分析了来自病原体的蛋白质,并确定了那些具有一个类组蛋白尾部结构域,并在细胞核中积聚的被感染细胞。筛查发现了H3N2甲型流感病毒的一种非结构蛋白,NS1,它已知在抑制宿主的抗病毒反应中扮演了一个关键角色。作者发现,H3N2 NS1的羧基末端由一个非结构域构成,含有一个4氨基酸基序,ARSK,它在化学上类似于组蛋白H3中的赖氨酸4位点(H3K4)。NS1尾部缩氨酸的体外分析证实,作为一个组蛋白修饰酶的底物,它经历了甲基化和乙酰化。这些修饰还发生在被病毒感染的细胞的NS1上。

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越是简单越是好计划,什么是笨蛋法则?–知识分享

管理大师德鲁克年轻时在伦敦一家银行工作,写了一份重组建议,他的上司说:“很好,我们把路易斯找来测试一下,看看他觉得你的计划怎么样?”德鲁克对上司说:“路易斯是我们公司年纪最轻的记账员,而且正如你在几天前观察的心得,这个人简直是个笨蛋。” 上司说:“没错。如果连他都可以了解你的计划,我们就进行吧。假使他不明白,这个计划恐怕太困难,而无法运作。我们在做每一件事情的时候,都得考虑到傻瓜——因为事情到最后总是要由一些傻瓜来完成。”

 

    很多时候,一个计划没法执行下去,都是因为制定计划的人太高估执行者的水平。“笨蛋法则”启示我们:简单到连“最笨的人”都能领会和操作,那就是一个好的计划,因为事情到最后总是由一些“笨蛋”来完成。

 

    亲爱的读者,您知道什么是笨蛋法则吗?您对“笨蛋”有哪些想法?请根据以下提示词,搜索相关的资料。结合您的亲身体会、畅所欲言,谈谈您的看法。

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管坤良:揭示Hippo和TOR信号通路

管坤良:揭示Hippo和TOR信号通路

早年毕业于杭州大学的管坤良教授主要从事细胞生长调控、肿瘤生物学以及神经生物学的信号转导途径等方面的研究,他曾荣获过包括美国“麦克阿瑟天才奖”在内的多项荣誉,现任加州大学圣地亚哥分校教授,浙江大学生命科学研究院兼职教授、共同院长等职务,近期他与另外两位研究人员发表了题为“Organ Size Control by Hippo and TOR Pathways”的点评文章,介绍了两条重要的途径:Hippo通路和TOR通路在调控器官尺寸方面的重要作用,文章公布在5月8日Current Biology杂志上。

在生物发育过程中,每一个器官到底应该长多大,受到精密的调控,器官大小必须与全身其它部位相互协调,要不一个小小的身体,长了一个很大的心脏,或者左腿比右腿长20厘米,都不相配。

这个过程是一个高度协调和复杂的调控过程,受到细胞数量,或者细胞大小的精确规划。器官尺寸的变化常常与许多人类疾病相关联,比如肥大症,退行性疾病,和癌症。Hippo和TOR都参与了器官大学调控的关键信号通路,能分别调控细胞数量和细胞大小。

在这篇文章中,研究人员概况了器官生长调控的整体机制,并描述了Hippo和TOR如何能操控细胞和器官生长的关键方面,最后还探讨了近期发现的,有关这两个关键因子在器官大小调控方面的可能相互作用。

Hippo信号通路是一条细胞抑制生长性信号通路,在进化过程中非常保守,多细胞动物果蝇、小鼠、哺乳动物中都存在Hippo。最早研究人员在果蝇中就发现Hippo信号传导路径是调节细胞大小,器官体积的主要信号通路。

近期还有研究证实,Hippo通路的新的细胞信号传导途径对器官大小的调控起着至关重要的作用。例如敲除该通路中的激酶基因Mst1/2导致小鼠肝脏过度生长至正常大小的四倍。Hippo通路的蛋白激酶能够导致YAP和TAZ转录辅激活因子的磷酸化和失活进而抑制细胞增殖,促进细胞凋亡。

进一步的研究显示这条信号通路还调控干细胞自我更新及组织再生,特别是与癌症的发生密切相关。因而该通路的研究不但是发育生物学的重要课题,而且对人类疾病的治疗具有指导意义。最新的证据还表明Hippo通路受细胞极性,细胞粘附和细胞连接蛋白的调控。

去年管坤良教授就在Nature cell biology上发表文章,系统综述了Hippo信号传导通路组成及调控机制,并重点对器官大小和组织再生调控过程中细胞极性蛋白和细胞粘附蛋白对Hippo信号传导通路的影响及机制进行了综述和探讨。

而TOR——雷帕霉素靶蛋白(target of rapamycin,TOR) 更是早就引起的科学家们的注意,这一蛋白是一个磷酸激酶,能够催化很多蛋白的磷酸化,在细胞生长和代谢中具有重要作用。近年来研究发现mTOR与人体炎症、损伤、增生、组织修复、纤维化以及肿瘤发生发展等一系列重要的病理生理过程密切相关。

除此之外也有越来越多的证明表明,TOR在细胞大小和增殖中的中央调控作用,这一作用是由于TOR能对mRNA翻译起始执行调控功能——TOR以来的核糖体p70S6激酶被磷酸化,从而启动核糖体蛋白的翻译,同时cap-依赖的mRNA翻译则因为真核翻译起始因子4E结合蛋白1被TOR磷酸化失活而开始的。

细胞生长并不是简单的细胞体积和质量的增加,而是发生在特定时间和地点,并受到精确调控的过程,细胞生长于细胞增殖,凋亡相互协调才能确保成为合适的细胞,器官大小。因此生物体中组织器官大小和体积的调控也一直是生物学研究的最基本的问题之一。如果能深入了解这一领域的分子机制,对于解析相关的人类疾病具有重要意义。

专家简介:

管坤良,1963年出生于浙江桐乡,博士。现任美国加州大学圣地亚哥分校药学及癌症中心教授。Purdue大学生物化学博士;复旦大学生物医学研究院基因组研究所和分子细胞生物学实验室兼职杰出PI。

1982年获杭州大学生物系学士学位。1983-1989年于Purdue大学师从Henry Weiner攻读生物化学并获博士学位,其后于该系从事博士后研究。1992-1996年任密歇根大学生物化学系的助理教授,1996-2000年任副教授,2000年起任教授,2003年至2007年任密歇根大学生命科学研究院Halvor N.Christensen教授。2007年至今任加州大学圣地亚哥分校药学及癌症中心教授。1995-1999年任国家科学基金细胞生物学组评审员,1997-2002年任期刊Journal of Biological Chemistry编委,1999-2003年为NIH评委CDF-3组成员。被美国国立卫生研究院 (NIH)、中国国家自然科学基金委员会等聘为特约评审专家。1984年获”农业协会荣誉会员”称号,1989年获Purdue”Arnold Kent Balls奖”,1998-2003年获MacArthur基金会奖,同年获美国生物化学与分子生物学协会”Schering-Plough奖”和华人生物学家协会”青年科学家奖”,2004年获密歇根大学”优秀教员奖”。长期从事信号转导、肿瘤生物学等研究,主持美国NIH多项R01基金及其它众多基金项目,在 Cell, Nature, Science, Genes & Development, Natur Cell Biology 等国际学术期刊发表论文150余篇。

原文摘要:

Organ Size Control by Hippo and TOR Pathways

The determination of final organ size is a highly coordinated and complex process that relies on the precise regulation of cell number and/or cell size. Perturbation of organ size control contributes to many human diseases, including hypertrophy, degenerative diseases, and cancer. Hippo and TOR are among the key signaling pathways involved in the regulation of organ size through their respective functions in the regulation of cell number and cell size. Here, we review the general mechanisms that regulate organ growth, describe how Hippo and TOR control key aspects of growth, and discuss recent findings that highlight a possible coordination between Hippo and TOR in organ size regulation.

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Nature:ATP激活P2X受体离子通道的机制

Nature:ATP激活P2X受体离子通道的机制Mechanism of activation.

P2X 受体是ATP激发的离子通道,Na+、K+ 和Ca2+ 离子可以从中渗透。这些蛋白参与一系列生理过程,其中包括突触传输的调制、平滑肌的收缩、化学传递介质的分泌和免疫反应的调控。在这项研究中,作者们报告了在ATP存在和不存在两种情况下斑马鱼P2X4受体的X-射线晶体结构。与ATP相结合的结构显示了一个以前没有被看到的主题,同时两种结构的对比表明,ATP的结合导致细胞外前庭的辐射状扩大,这会引起跨膜螺旋体像虹膜一样的扩张,从而将该离子通道打开。

原文摘要:

Molecular mechanism of ATP binding and ion channel activation in P2X receptors

P2X receptors are trimeric ATP-activated ion channels permeable to Na+, K+ and Ca2+. The seven P2X receptor subtypes are implicated in physiological processes that include modulation of synaptic transmission, contraction of smooth muscle, secretion of chemical transmitters and regulation of immune responses. Despite the importance of P2X receptors in cellular physiology, the three-dimensional composition of the ATP-binding site, the structural mechanism of ATP-dependent ion channel gating and the architecture of the open ion channel pore are unknown. Here we report the crystal structure of the zebrafish P2X4 receptor in complex with ATP and a new structure of the apo receptor. The agonist-bound structure reveals a previously unseen ATP-binding motif and an open ion channel pore. ATP binding induces cleft closure of the nucleotide-binding pocket, flexing of the lower body β-sheet and a radial expansion of the extracellular vestibule. The structural widening of the extracellular vestibule is directly coupled to the opening of the ion channel pore by way of an iris-like expansion of the transmembrane helices. The structural delineation of the ATP-binding site and the ion channel pore, together with the conformational changes associated with ion channel gating, will stimulate development of new pharmacological agents.

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B病了,为什么让A吃药?--知识分享系列

有个农夫养了两头驴子,A驴比较听话、载货能力也比较强;B驴很不听话、载货能力也比较弱。农夫想多接点活,到底该给那头驴子加点任务呢?

农夫首先找B驴,B驴首先是态度不好、载货水平也确实差,即使愿意载农夫还不放心呢;没办法,农夫又去找A驴,喜出望外的是A驴很容易的被搞定了。

农夫顺利的增加了业务量,也找到了一个解决规律,也就是“B病了可以让A吃药。农夫有时候也知道A太吃亏了,但是没办法啊,不可能不做业务啊,要干活现在也确实没其它办法,只有让A多做一点啊。治标的表象迷住了农夫的眼睛,短期利益的追逐成功让农夫志得意满,甚至把“B病了可以让A吃药当成了管理心得。
为什么B病了,可以让A吃药呢?您是怎样看待这个问题呢?您身边是否也有类似的案例呢?

 

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全球著名生物制剂公司

全球著名生物制剂公司

Santa公司是世界上最大的抗体生产厂家,目前可提供的抗体种类多达两万多种,几乎覆盖了目前生命科学研究的各个最新领域,其每种抗体又有多个克隆可以选择,还提供一些对应蛋白标准品及相关产品,如ABC试剂盒,各种标记二抗,Western试剂盒,蛋白分子量Marker,核抽提物等,为免疫学研究工作提供了极大的方便。

Abcam公司是世界有名的抗体王国,以优质、齐全的产品、完善的网络支持功能和强大的技术支持队伍得到全球客户的认可和赞誉。并在2004年获得了对于生物界公司不可多得的英女王奖,拥有很好的知名度和口碑。产品具有以下特点:

1、全:网络全世界的优质产品,基本上各种抗体产品在该公司均能找到

2、新:产品及网站更新非常快,基本上每周均有新产品出现

3、优:产品质量好,投诉比较少

4、强:强大的技术支持队伍和力量,网站上有齐全的技术资料以及客户评论,并提供实时在线技术咨询,使您使用产品时没有任何后顾之忧。

R&D公司于1976年成立于美国,一直致力于各种细胞因子及其相关分子的生产研发,其生产的各种ELISA试剂盒、重组因子及抗体以其卓越的品质赢得了世界各国科研及临床诊断机构的青睐。 是全世界最大的细胞因子公司。该公司产品丰富涵盖了百余种细胞因子类ELISA试剂盒, 重组细胞因子类蛋白(209种之多)及相关的多达250余种单克隆、多克隆抗体;细胞凋亡、Caspase及胶原酶系列以及细胞因子类等热点领域。

MBL,成立于1969年,是日本第一家抗体生产商。

公司早期致力于研究生产血浆蛋白质抗体,是抗体研究、发展和生产的先锋者。现在,公司提供3000多种细胞骨架、致癌基因产品和信号转导蛋白质抗体。

1975年,MBL成为日本首家血浆蛋白质的诊断剂的生产商,之后,公司就致力于开发、生产免疫诊断试剂,特别是自身免疫性疾病方面的诊断试剂。公司的研发能力在该领域中得到了极高的评价。MBL的自身免疫性疾病的诊断剂对医药界贡献非常大,该公司产品在自身免疫性疾病方面占据了日本国内市场80%的份额,在海外市场也同样受到欢迎。

近年来,MBL大力引进重组DNA细胞和细胞融合技术来开发用于疾病诊断和疗效观察的诊断试剂。另外,公司开发了大量分子生物学和细胞生物学研究的产品,包括抗体和可溶性Fas ELISA试剂盒。

Cell Signaling Technology(CST)是最知名的和老牌的信号转导公司之一,专注于信号转导产品的提供和研究。产品具有种类多、质量好、价格低、引用文献多等优点,是您进行信号转导研究不可多得的帮手!

Zymed Laboratories公司位于美国生物科技重要城市南加州的圣迭亚哥市,目前是Invitrogen大家庭中的一员。是一家以生产免疫学检测试剂为主的综合性生物技术公司。Zymed公司的业务主要分为两大领域:生命科学和临床病理诊断。Zymed公司的所有产品反映了其在全球的自我定位策略-即一家重视质量、专注于全面解决问题的开发商、生产商和全球营销商。它在全球范围内为生命科学研究、临床研究、癌症诊断领域提供高质量的试剂和试剂盒。Zymed公司历史悠久,在抗体设计、开发、修饰、纯化和生产方面有21年的专业研究史。Zymed 公司得到 ISO 13485认证。

台湾Abnova是世界上最大的单克隆抗体生产商之一,现有抗体产品种类近10000种,其中2/3是单克隆抗体。和传统的单克隆抗体生产方法相比,Abnova采用更先进的技术和设备,可以极大地提高单克隆抗体的生产效率并降低其生产的成本。Abnova具有每个月开发500个小鼠单克隆抗体的能力,他们的目标是:人类基因组中的每一个表达基因都至少有一种抗体。

享誉全球的生命科学试剂研发和经销大公司,其产品涉及到神经生物学、细胞外基质、信号传导和传染病研究。公司拥有强大的研发背景,是许多生化试剂技术如ESGRO、LIF专利的拥有者和独家生产者,公司拥有严格的质量控制体系和十分完善的售后服务体系,在客户中树立了良好的信誉。

http://www.novusbio.com

Novus位于美国科罗拉多州,是一家著名的抗体公司。公司的愿景是提供优质的产品,完善的客户服务以帮助客户快速找到最适合的抗体产品。通过全球代理商和网络提供10000多种研究级抗体,涉及生命科学的各个领域。

Merck是生命科学领域的旗舰企业,拥有以下品牌:

Calbiochem corp. 为全球最大的信号转导类产品供应商。

Stratagene Cloning System. Stratagene产品涉及到分子生物学、蛋白质组学、药物研发等领域。

Oncogen 产品集中在细胞凋亡及周期研究领域,产品专而精。

Novagen 产品线从上游的基因及蛋白分离到表达、分析、纯化,覆盖面宽。

Biodesign 美国主要的工业及研究用免疫学产品供应商,公司符合ISO 9001,FDA,GMP等多项认证,获得USDA许可,其产品超过4500种,在全球有40多个分销商,为生命科学研究,药物制造,生物技术及诊断产品开发及生产等多个领域提供抗体、抗原、免疫检测全套免疫学产品。

Ambion公司以开发RNA研究方面的产品而闻名于世。该公司主要提供RNA分离纯化,RNA保护,RACE,RT-PCR,Northen杂交,突变分析等方面的优质产品。

Pierce公司是蛋白质化学、免疫学和层析等很多方面的先驱和领导者,主要产品包括:化学发光体和比色底物、分析试剂、荧光标记探针、酶联免疫分析试剂盒等。

BD 产品涉及分子生物学、细胞生物学、免疫学和蛋白质组学等诸多领域,旗下拥有Clontech 、Discovery labware 、Pharmingen 、Falcon 等质品牌,值得称赞的是每一个品牌在其所在的领域都是其中的佼佼者。

PeproTech 位于英国,在美国也有公司。成立12年来,公司已开发了200种以上的重组细胞因子和相关抗体.所有产品以冻干形式提供,以方便运输和储存.目前公司正在扩大产品线,生产抗原亲和多抗及其生物素标记物,ELISA试剂盒和新型抗体。主要以小包装的细胞因子受广大研究生客户喜爱。

Fermentas 是一家经过ISO9002认证的来自立陶宛的生物技术公司,是世界第二大工具酶和分子生物学试剂盒生产商。该公司现在以Fermentas替代原有的 MBI Fermentas商标生产和出售分子生物学产品,通过其全球分销商网络推销其产品。该公司产品包括限制性内切酶、DNA甲基化转移酶、DNA/RNA修饰酶、PCR产品、核酸Markers等。由于该公司地理位置的特点,因而生产成本低廉,故可向研究者提供相对低廉的科研产品。其客户遍及欧美地区,产品质量备受各地用户的赞誉和推崇。

Cayman 向世界科学工作者提供多研究领域的生化和免疫试剂。包括:肿瘤、氧化氮、神经学、凋亡、氧化性损伤、内分泌学等等。他们有用于检测的特色试剂盒,如:类花生酸类物质、游离的生物标志、环核苷、激素及氧化氮等。另外,Cayman提供多种高质量试剂,包括:类花生酸类物质、氧化氮试剂及许多相关脂质、脂肪酸、酶和抗体。

德国美天旎公司是一个以细胞分选技术为主、拥有多样化产品的生物技术公司。主要开发研制并销售世界上最先进的细胞分选、细胞生物学、相关分子生物学产品和技术,尤其在干细胞分选、DC细胞分选与分析、细胞因子分泌细胞分选与分析、免疫治疗、再生医学方面占有极大的优势。CD133、BDCA- 2(CD303)、BDCA-4(CD304)单抗均为其专利产品。

Assay Designs位于美国的密歇根州,成立于1992年,为全世界生化、医药专业的科研工作者提供优质、快速、方便的产品,”使您的科研更为简单”。公司目前可提供检测和定量细胞调节、信号转导、炎症、氧化过程和凋亡相关的分子。公司最近开发了CORRELATE 和TITERZYME 免疫试剂盒,活性检测试剂盒、FLASHLIGHT and BIOLIGHT 发光混合物、抗体等。Assay Designs 提供各种eicosanoid试剂盒、人和小鼠的细胞因子试剂盒以及世界唯一的非放射性COX活性检测试剂盒,其精确和重复性无与伦比。另外,公司大量提供抗原和抗体相关产品。

Dynal Biotech ASA.,成立于1986年,是一家在德国、法国、英国、美国、中国及澳大利亚均设有分公司的跨国公司,总部位于挪威奥斯陆。总公司一直致力于磁性分离技术和HLA相关产品的研究、生产和销售。经过多年发展,其产品线已覆盖了免疫学、分子生物学、微生物学、HLA等生命科学领域。1996年,Dynal Biotech ASA 通过了ISO9001质量体系认证;2002年,两个系列产品取得CE认证;2003年,再次通过ISO9001:2000以及ISO13485质量体系认证。2004年3月,其产品通过了美国FDA认证。

2005年2月,Invitrogen公司成功收购Dynal Biotech公司。

Dynal网站:www.invitrogen.com/dynal

Dynal中国网站:www.invitrogen.com.cn/dynal/

Invitrogen 是全球领先的生命技术公司,公司创立于1987年,总部位于美国加利福尼亚州卡尔斯巴德。主要为全球从事生命科学研究的学术、政府研究机构、医药和生物技术公司提供生物技术产品和服务。Invitrogen将研发力量集中在包括功能基因组、蛋白组学、生物信息学和细胞生物学等生命科学研究领域内的突破性创新,向全球各主要实验室提供在研究中所需要的新技术、新产品及服务。

Invitrogen旗下包括Invitrogen、Gibco、 Molecular Probes、Dynal、Biosource、Caltag、Zymed、Panvera、InforMax、BioReliance等众多行业顶尖品牌。为分子生物、疾病研究,药物研发和生物制品生产等提供全面的技术和服务。

Invitrogen的壮大历程:

2005

Dynal 细胞分离与纯化用磁珠、细胞刺激、蛋白质研究、核酸研究和微生物学

Zymed 病理学、癌症和细胞生物产品,一般免疫化学试剂

BioAsia 引物合成及测序,合并后的公司称为上海英骏生物技术有限公司

2004

DRI DNA纯化产品和其它核酸

Protometrix 蛋白质微阵列技术

BioReliance 合同服务机构(CSO)假设测试,为全球生物技术和制药公司提供生物药品开发和生产服务

2003

Sequitur RNA干扰技术(RNAi)

Molecular Probes 为生物研究和药品开发提供分子分类方面的荧光技术

Genicon Sciences 超敏感信号产生与探测工具和方法

2002

PanVera 生物化学、细胞检验和蛋白质收集

InforMax 生物信息软件

2000

Life Technologies 分子生物和GIBCO细胞培养试剂

Ethrog 电泳完全附着系统

Research Genetics 为基因药品开发研究提供cDNA克隆

1999

NOVEX 预制电泳胶

作为细胞培养的金字招牌,GIBCO是在此领域的领导者,现在是Invitrogen的一部分。Gibco可以提供最为广泛的品种以满足用户不同的需求,每一种产品都通过最为严格的品质管理。同时,Gibco也可按客户的要求对培养基的配方进行改动,或完全按客户的配方进行生产。

在培养基的剂型方面,GIBCO可以提供传统的干粉剂型,这种剂型有利于长期储存并节省储存空间;同时,也可提供工作浓度的液体剂型,您可因此节省大量的时间和人力,并可减低因人为因素造成的每一批次培养基之间的差异;此外,10倍和50倍浓缩液体培养基,则结合了以上两种剂型的优点。新型高级颗粒化技术(AGT)培养基则是一种全新的、易于使用的、pH值预先调节的颗粒状的干粉培养基,AGT™ 形式使许多的复杂配方适用于干粉培养基,提供了完全单一组分的形式,从而易于使用和从研究到生产的按比例放大。

GIBCO还提供多种无血清和无蛋白培养基,无血清培养基是设计用来在无血清条件下生长特殊类型的细胞或进行专门应用的培养基。无蛋白培养基中没有添加蛋白,但是仍然可能包含一些动物或植物来源的成分。而限定化学成分培养基则是明确每一种化学成分、无任何动物来源组分的培养基,消除了对培养基生物安全性的任何担忧。Advanced系列培养基则可减少50~70%的血清用量。

在提供细胞培养基,平衡盐溶液和培养用试剂的同时,GIBCO提供高品质的血清。GIBCO自1961年开始生产用于细胞培养的动物血清,是此行业的开创者。在三十多年的岁月里,一直保持在技术和品质方面的领先水平,血清和培养基的市场占有率常年蝉联全球第一。

Molecular Probes,作为Invitrogen的全资子公司,是全球最主要的用于先进的生物医药和其他科学研究的荧光检测产品的供货商,应用于基因组学,蛋白质组学及细胞生物学标记等方面,服务于全球顶级的商业机构和科学实验室。自1975年成立以来,作为荧光技术的先锋,已经实现了基于持续的革新、卓越的服务和客户高满意度之上的高速增长。Molecular Probes已建立了多达3000种的荧光探针和生物化学品的生产线,使得在诸如分子和细胞生物、免疫学、生物化学和神经科学等不同领域的领先研究项目成为可能。

主要的产品类别

生物检定

提供荧光的、发光或显色底物和试剂盒,用于快速、灵敏地评估代谢物和酶活性,并可简单地优化用于高通量筛选。包括用于生物检定和仪器质控的产品。

细胞生物学

提供测量细胞增殖和活力的试剂、细胞器探针和染料,以及用于细胞凋亡、受体亲和、内吞作用和吞噬作用等研究的探针和试剂盒。包括显微成像的工具和配件。

离子指示剂

包括钙、镁、钠、重金属、pH 和其他离子的荧光指示剂,以及螯合因子和钙标度试剂盒。

微生物学

提供用于细菌和酵母研究的荧光试剂,包括酵母和细菌活力检测试剂盒、标记的抗生素和酵母细胞器染料。

微球体

提供用于不同用途的荧光标记的微球体,包括用于血流检测、蛋白质或DNA捕获检测、细胞示踪以及在单个细胞中进行的多重分析检测,以及用于显微镜和流式细胞仪的标准品。

分子生物学和基因组学

提供超敏感的SYBR凝胶染料、高通量定量检测以及采用我司的Alexa Fluor技术进行可靠的DNA和RNA标记的试剂盒,还包括用于原位杂交、报告基因检测和基因芯片质控的独特产品。

蛋白质生化和蛋白质组学

提供用于总蛋白、磷蛋白、糖蛋白和经过1-D和2-D 凝胶电泳和转印的标记蛋白质分析的荧光染料。包括用于多色蛋白质转印和超敏定量检定的产品。

活性染料和化学品

提供设计用于高效附着到不同的功能基团的化学活性的荧光团、生色团、半抗原、荧光染料淬灭剂和交联剂等,也包括使用这些试剂的完整的蛋白质和核酸标记试剂盒。

二级检测

提供Zenon抗体标记试剂盒、二级抗体复合物、生物素/亲合素和凝集素检测试剂盒。也包括信号放大产品和针对荧光染料和蛋白质的抗体。

信号转导

提供用于检测、调控和抑制信号转导途径中关键因素的试剂,包括磷酸酶、激酶、活性氧和氮、脂肪代谢、生长因子和钙调控等。

DSL公司位于美国的得克萨斯州,成立于1981年,致力于诊断产品的研发和生产,是世界上激素检测领域的领先者。DSL公司本着顾客至上的原则,能更迅速的适应变化,提供给客户最好的产品和服务。

公司平均每年推出20-30种新产品,可以提供给客户最新的产品和服务:

·免疫诊断分析和内分泌检测试剂

·传染病诊断

·研究用试剂

·CLIA认证的实验室

·抗体开发,蛋白质纯化的研发

罗氏公司(Roche)应用科学部致力于生命科学领域产品的开发,向用户提供优质的科研产品。在1998年收购德国宝灵曼(Boehringer Mannheim)公司后,产品涵盖了分子生物学,细胞学,免疫学,蛋白质组学,生物化学等多个研究领域,罗氏拥有PCR以及地高辛标记产品的全球专利,其DIG标记产品和细胞凋亡相关产品在业内享有极高的声誉。五十年来,罗氏应用科学部专注于生命科研领域产品的开发和推广,如今已经有超过2000种的科研产品在市场上销售,覆盖了生命科学研究领域的各个方面,为科研工作者提供完整的解决方案。

BioLegend 公司位于美国加州,致力于为生物医药研究的各个前沿领域提供高质量的抗体及其它相关试剂。BioLegend聚集了一批来自PharMingen公司的专业人士,建立了一支具有雄厚技术背景的专业队伍,其中该公司的CEO更是为PharMingen公司的创始人之一。通过其自身的先天优势,以及与世界知名实验室和研究所的良好合作关系,其目标是以最合理的价格为广大客户提供高质量的免疫学和细胞生物学产品。BioLegend公司以其专业技术力量为保证,提供各种质量卓越的产品,并不断地开发新产品,以满足飞速发展的生命科学研究的需要。

来自美国圣地亚哥的eBioscience公司,以其高品质的产品,良好的服务及实惠的价格赢得了多家世界顶尖实验室和科研机构的青睐。目前该公司一直致力于炎症方面的单克隆抗体的研究,在TLR方面有着很高的长久。

Finnzymes 公司是一家专门从事生产PCR相关产品、转座子相关产品和胎牛性别鉴定试剂盒等分子生物学产品的芬兰公司。该公司主打产品有:RT-PCR和定量PCR试剂盒及相关产品、模板生成系统(TGS)、随机突变系统(MGS)、胎牛性别鉴定试剂盒Ampli-Y等。

BIOSOURCE 是一家本部位于美国的全球性专业提供生命科学试剂的著名公司。它专著于为功能基因组学研究和药物开发提供”不断探索-不断发现”的生命科学试剂,产品涉及生命科学的多个领域,尤其是细胞信号转导、神经生物学、细胞因子和相关活性蛋白的检测及表达、依托于Luminex技术的高通量检测平台以及包括培养基、血清、添加剂、抗生素等的完整的细胞培养用品。

SBA(Southern Biotechnology Associates, Inc.)公司建于1982年,由美国伯明翰的阿拉巴马大学(UAB)的Dr. Max Cooper细胞免疫学实验室的科学家创建。SBA致力于高质量、高亲和纯化的二抗的生产、纯化和标记。同时,SBA还提供各种亲和纯化的多克隆和单克隆抗体,其中包括:荧光素和酶标记物,低内毒素/不含叠氮化物(LE/AF)制剂,F(ab)和F(ab‘)2,此外还有纯化的免疫球蛋白和胶原质。

NeoMarkers (Lab Vision & NEOMARKERS) 公司在免疫组织化学产品领域上处于世界领先水平。Lab Vision & NEOMARKERS从研究与临床需要出发,设计开发产品,真正满足实际要求,产品已被生命科学研究群体所广泛认同;有完善的专业文献资料积累,所有产品都提供详细的技术资料与重要的相关文献;产品提供多种规格,单抗有0.1ml和1.0ml与即用型(7ml)以及纯化的抗体(试用型20ug,100ug 与200ug),可以适应各种不同要求,此外还可根据实验要求选择特定的产品形式或规格。

BioVision. Inc. 位于美国加州的Palo Alto,是世界上首屈一指专著于凋亡和细胞信号研究的公司。其产品质优、价廉、包装使用方便。BioVision致力于为研究者们提供最好、最新的研究工具而不断扩大产品及服务质量。该公司提供用于检测早、中、晚期凋亡的试剂,可以检测凋亡发生的不同区域,包括:线粒体、胞浆、胞膜及胞核。

KPL 公司是美国最早实现亲和素纯化二抗商业化的生物公司,同时也是世界上最大的二抗和底物显色系统的生产商。其可以提供高质量的用于分子生物学、免疫学、细胞生物学和体外诊断试剂,其产品有:亲和纯化的抗体和偶联物、ELISA和杂交底物、蛋白检测和纯化试剂盒、核酸标记和检测试剂以及其它辅助试剂等。

Linco 公司主要致力于糖尿病与肥胖症研究及相关领域的新产品研发,以为广大研究人员提供值得信赖的高品质产品而自豪。在Luminex技术基础上开发出的 LINCOplexTM系列产品,可以在一份25ul的样品中同时定量检测多种蛋白质分子。该系列包括人、小鼠和大鼠细胞因子检测试剂盒、 apolipoproteins检测试剂盒和内分泌检测试剂盒,其中的细胞因子检测试剂盒可以根据客户的研究需要灵活提供(最少3种细胞因子)。 Linco公司还在不断努力,为该系列试剂盒提供更多的检测指标。

MABTech是瑞典的一家生物公司,成立于1986年;他们生产高质量的单克隆抗体,一直致力于ELISpot配套抗体的研究,其ELISpot技术处于世界领先水平.

MABTech公司目前生产的ELISPOT细胞因子检测试剂盒涉及多个种属:

Human: IFN-gamma、CEF Peptide pool、Inteferon-alpha、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-10、IL-12(tot IL-12)、IL-12(IL-12 p70)、IL-13、GM-CSF、TNF-alpha、Perforin、Granzyme B

Monkey: IFN-gamma、IL-2、IL-4、IL-5、IL-6、IL-12(tot IL-12)、IL-13、GM-CSF

Mouse: IFN-gamma、IL-2、IL-4、IL-5、IL-10、IL-12(tot IL-12)、IL-12(IL-12 p70)

Bovine: IFN-gamma

MABTech公司提供四种类型的ELISPot试剂盒和相关配套试剂:

1、 ELISpot PRO kit:包括包被有捕获抗体的PVDF板、ALP标记的检测抗体、BCIP/NBT底物。

2、 ELISpot PLUS kit:包括PVDF板(白色)、捕获抗体、生物素化检测抗体、ALP标记链亲和素、BCIP/NBT底物。

3、 ELISpot kit:包括包被抗体、生物素化检测抗体、酶(ALP或HRP)标链亲和素。

4、 抗各种细胞因子的抗体对

Sigma – Aldrich 公司是世界上著名的生化试剂,有机试剂,色谱分析产品和诊断试剂等产品的供应商。它拥有五个品牌的产品,每个品牌服务于不同的专业领域,提供 200 , 000 以上不同品种的产品。 Sigma:提供用于生命科学研究领域的生化试剂和耗材; Aldrich: 提供化学合成的有机和无机试剂; Fluka : 提供化学研究的特殊试剂和分析试剂; Supelco: 提供色谱研究方面的产品; Riedel-de Haen: 提供实验室化学药品和试剂。

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新产品:Mesolens显微镜有助于药物开发

新产品:Mesolens显微镜有助于药物开发

进步始于创新。常规显微镜往往难以清楚捕捉生命体的细节特征,而Mesolens显微镜能够突破这一瓶颈实现生物体的大范围观测。Mesolens显微镜是格拉斯哥的斯特拉斯克莱德大学研究员们目前正在研发的新产品,这种透镜能同时呈现出两种图像——细胞和组织内部的三维图像以及整个生物体的图像。完成观察过程可缩短至几秒钟。

Amos博士是医学研究委员会(MedicalResearchCouncil)分子生物学实验室研究组荣誉组长,也是皇家学会会员。他说,“21世纪急需全新有力的治疗手段应付全球健康挑战,但是药物从研发到投入使用的过程往往费时费钱。”显微镜传递的信息对于这一过程至关重要,但显微镜每次成像可能需要若干小时。

同焦透镜可以实现两个部分同时成像——单独细胞和整个生物体的表面或内部,它具有很高的分辨率,并且可以提供3D图像,极大地突破了2D图像的局限性。

斯特拉斯克莱德大学药学和生物医学学院的讲师GailMcConnell博士也是这项研究的合作伙伴。她说:“我们的研究彰显了斯特拉斯克莱德大学技术创新的精神,将带来巨大的影响力。现存的透镜已经应用了二维技术,但是三维技术将会为我们带来图像效果革命性的进步。目前没有一个成像平台能够比拟其成像范围以及多功能性方面的优势。”

顶尖专家学者正与医药领域密切合作,试图研发出更为先进的技术,实现更及时准确的疾病监测确定更完备的治疗手段,以及终身疾病预防。 它将大大加快新药的开发速度,在癌组织以及大脑皮层研究方面发挥重要作用。(生物帮bio1000.com)

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我为什么总为别人做嫁衣?--知识分享系列

一位车间主任,一人想办法解决了生产流程中的问题,总有个别人跑到老板面前说自己的想法,以此邀功。怎样才能避免类似事件发生呢?


话题来源:用户:想精明起来

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首发抗生素跨代影响研究成果

首发抗生素跨代影响研究成果

在2012年4月27日版Scientific Reports上,刊出一篇论文,该文指出:雄性伪蝎用四环素治疗后,精子活力显著降低,并将这一毒性作用传递给它们未用四环素治疗的子代,这一类似效果也可能发生于人类和其他物种。它是第一篇表明抗生素跨代影响的研究。

在此研究中,以三代伪蝎为研究对象,将21窝伪蝎分为两组,一组为对照组,不用四环素处理,另一组从出生到成年用周剂量四环素处理,以便控制第一代中的遗传影响。随后几代不用四环素处理,结果发现:四环素对雄性或雌性身体大小、精子数量或女性生殖没有影响;对雄性伪蝎生殖功能和精子活力有很显著的不利影响,可将精子活力降低至25%,并且这种影响可传至子代,但在子代后的世代中没有观察到这种影响。四环素可能诱导雄性生殖组织后生变化,这些变化可传递给子代,不改变DNA序列,却改变基因表达方式。

广谱抗生素四环素被广泛用于动物生产、抗生素治疗及治疗节肢动物沃尔巴克氏内共生菌感染。尽管六十多年治疗与农业应用已导致细菌普遍耐药性的演变,四环素仍然常用作发展中国家的动物饲料添加剂和方便的抗菌疗法。此研究是国家科学基金资助项目的一部分,该项目主要调查研究雄性低生育的影响因素。

原文摘要:

From father to son: transgenerational effect of tetracycline on sperm viability

The broad-spectrum antibiotic tetracycline is used in animal production, antimicrobial therapy, and for curing arthropods infected with bacterial endosymbionts such as Wolbachia. Tetracycline inhibits mitochondrial translation, and recent evidence indicates that male reproductive traits may be particularly sensitive to this antibiotic. Here, we report the first multi-generation investigation of tetracycline’s effects on ejaculate traits. In a study of the pseudoscorpion, Cordylochernes scorpioides, in which siblings were randomly assigned to control and tetracycline treatments across replicate full-sibling families, tetracycline did not affect body size in either sex, female reproduction or sperm number. However, tetracycline-treated males exhibited significantly reduced sperm viability compared to control males, and transmitted this toxic effect of tetracycline on sperm to their untreated sons but not to their F2 grandsons. These results are consistent with tetracycline-induced epigenetic changes in the male germline, and suggest the need for further investigation of transgenerational effects of tetracycline on male reproductive function.

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核酸研究:急性T淋巴细胞白血病发病机理研究新进展

核酸研究:急性T淋巴细胞白血病发病机理研究新进展

华中科技大学生命科学与技术学院郭安源教授研究组近期在《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志(IF 7.8)上发表了文章,首次揭示了miR-19抑制CYLD蛋白的产生,继而激活下游的NFKB信号通路,导致T淋巴细胞增殖失控。这项研究成果从系统网络水平研究急性T淋巴细胞白血病的发病机理和调控过程,为其诊断和治疗提供理论依据,并为复杂疾病的研究提供了计算和实验交叉的新思路和方法。

急性T淋巴细胞白血病(T-ALL)是一种进行性的血液系统恶性疾病,以高外周血细胞计数、原始细胞增多、中枢神经系统浸润和纵隔肿瘤为特征,好发于儿童和青少年。当淋巴母细胞(一种未成熟的白细胞)变成恶性、不受控制地增殖并迅速扩散至全身时,T-ALL便发生了。该疾病进展凶险,如果不进行治疗,疾病在几周内就可致命。

近年来尽管多药联合、大剂量化疗等治疗手段的不断改进,以及各类造血干细胞移植的应用和推广,但是该病的总体疗效和预后比更常见的B细胞系淋巴细胞白血病仍然要差很多。目前对于这一疾病发病的具体分子机理和调控机理还不清楚。

在这篇文章中,郭安源教授课题组以miRNA和转录因子的共调控角度为切入点,运用生物信息学方法,预测miRNA和转录因子与疾病基因之间形成的共调控前馈环模块,并由此构建共调控网络。通过深入分析该调控网络获得了其中的核心miRNA和基因。

并进一步对其中核心基因miR-19与CYLD在T-ALL中的分子机理进行了研究,首次揭示了miR-19抑制CYLD蛋白的产生,继而激活下游的NFKB信号通路,导致T淋巴细胞增殖失控。

作者简介:

郭安源 教授、博导。主要学习与工作经历:2002年毕业于南开大学,获生物化学学士学位;2007年毕业于北京大学,获生物信息学博士学位;2007.9-2009.9 在美国弗吉尼亚联邦大学和范德堡大学进行博士后研究;2009.10-现在 华中科技大学生命科学与技术学院。

研究领域:1.生物信息学和系统生物学在复杂疾病中的研究,包括大规模实验数据的分析和整合,疾病基因筛选,从蛋白质相互作用和网络通路等方面研究复杂疾病的分子机理;2.比较基因组学研究,不同基因组信息的比较以及特定基因和基因家族的起源进化;3.生物信息学数据库构建和在线分析工具设计。

原文摘要:

MicroRNA and transcription factor co-regulatory network analysis reveals miR-19 inhibits CYLD in T-cell acute lymphoblastic leukemia

T-cell acute lymphoblastic leukemia (T-ALL) is an aggressive hematological malignancy. The understanding of its gene expression regulation and molecular mechanisms still remains elusive. Started from experimentally verified T-ALL-related miRNAs and genes, we obtained 120 feed-forward loops (FFLs) among T-ALL-related genes, miRNAs and TFs through combining target prediction. Afterwards, a T-ALL miRNA and TF co-regulatory network was constructed, and its significance was tested by statistical methods. Four miRNAs in the miR-17–92 cluster and four important genes (CYLD, HOXA9, BCL2L11 and RUNX1) were found as hubs in the network. Particularly, we found that miR-19 was highly expressed in T-ALL patients and cell lines. Ectopic expression of miR-19 represses CYLD expression, while miR-19 inhibitor treatment induces CYLD protein expression and decreases NF-κB expression in the downstream signaling pathway. Thus, miR-19, CYLD and NF-κB form a regulatory FFL, which provides new clues for sustained activation of NF-κB in T-ALL. Taken together, we provided the first miRNA-TF co-regulatory network in T-ALL and proposed a model to demonstrate the roles of miR-19 and CYLD in the T-cell leukemogenesis. This study may provide potential therapeutic targets for T-ALL and shed light on combining bioinformatics with experiments in the research of complex diseases.

原文链接:Nucleic Acids Research

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